Mol Cell:张锋再造三合一Pop抗病毒的新型CRISPR Cas13系统

近日，柏克莱加州大学和康奈尔大学Broad研究成果机构传来向其：Pardis C. Sabeti、张锋等发现者联合开发出一种新型的特异性子系统。世界上有许多常见的致命病菌都是基于单链RNA的病原，看起来狂犬病病原、寨卡病原和亚型。该子系统在CRISPR Cas13新科技的基础上再次升级，可应用于探测和损坏生命巨噬细胞中所具有单链RNA的病原。该研究成果刊载在《Molecular Cell》杂志上。CRISPR子系统为特异性原理随之而来光明此前，张锋一个团队的研究成果管理人员凭借着CRISPR/Cas9子系统为补强神经子系统抵特异性入侵随之而来取而代之希望。然而，入侵生命的病原极为多变，即使是在同一种群内，也能不断充分利用环境。因此我们需要更为轻巧的预防病原游戏平台。为了探讨取而代之特异性方式而，研究成果管理人员将目光投靠了CRISPR Cas13子系统，Cas13蛋白质可以天然地基因表达细菌中所的病原RNA。它可以对蛋白质开展程序语言，从病原颗粒中所转换成特定的激酶真核生物。尽管CRISPR Cas13子系统基本上存在一些局限性，但是该原理在的实验室中所容易操纵，并且此前张锋一个团队的研究成果管理人员在两栖类巨噬细胞中所已经开展了充分的实验验证。研究成果管理人员开发了一种来由CARVER的新型游戏平台，它能将Cas13诱导的病原RNA乙烯与基于Cas13的较慢诊疗读数紧密结合起来，使用特定的高灵敏度蛋白质报告分子解锁（SHERLOCK）游戏平台，探测铲除基于RNA的病原。创始人三合一的子系统研究成果管理人员首先筛选了350多个生命相关病原（HAV）真核生物，以检验Cas13可以适当基因表达的病原RNA真核生物。他们主要寻找的是既不易基因型，又最有可能在接合后禁用病原的片段。病原真核生物中所潜在的Cas13最终目标残基康奈尔大学Cameron Sabeti的实验室的博士后Myhrvold博士指出：“也就是说，你可以程序语言Cas13来拦截病原的任何部分。但是种群内外和种群相互间都有前所未见的自然，随着病原的趋同，极少真核生物都起因了迅速的变化。如果你不小心，你可能会渴望最终没适当果的最终目标。”然后，他们通过计算分析脱氧核糖核酸文档，以确定数百种病原种群中所的数千个潜在残基，这些残基可能是Cas13的适当核酸。接下来，研究成果管理人员内外设计了该子系统的Cas13指导RNA。新程序语言的Cas13在感染了淋巴巨噬细胞性脉络膜脑膜炎病原（LCMV）、甲型亚型（IAV）和细菌感染性口炎病原（VSV）的生命巨噬细胞中所开展了实验测试。将Cas13过渡到混合物后24小时，研究成果管理人员判读到培养物中所病原RNA的高度增加了40倍。随后，研究成果管理人员检查了Cas1抑止病原感染性的能力。研究成果文档结果显示：病原暴露后八小时，Cas13将亚型的感染力增加了300倍以上。最后，该一个团队使用SHERLOCK探测新科技来实时测量Cas13基因表达后的病原RNA高度。该探测子系统提供了有关治果的较慢反馈以及有关特定病原基因型的文档。前言对于病原感染的病人，虽然已经批准后了90多种抗病物，但它们只能病人9种疾病。总体而言，只有16种病原具有FDA批准后的抗生素。因此，找到行之适当的特异性原理显得尤为重要。该研究成果的第一作者 Catherine Freije 指出：“Cas13可以是一种研究成果工具，来探讨生命巨噬细胞中所病原微生物学的许多方面，它也可能是一种诊疗工具，应用于诊疗样本，病人病原感染，并举例来说病人的适当性——所有这些都能让CARVER在取而代之或抗病毒病原显现出来时迅速充分利用和应对。”原始出处:PFreije CA1, Myhrvold C2, Boehm CK3, et a1.Programmable Inhibition and Detection of RNA Viruses Using Cas13.Mol Cell. 2019 Oct 2. pii: S1097-2765(19)30698-7. doi: 10.1016/j.molcel.2019.09.013. [Epub ahead of print]